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据报道RNA测序技术发展得更快更便宜

2019-04-21 11:28:18 • 来源：

来自洛桑联邦理工学院(EPFL)生物工程研究所的Bart Deplancke博士实验室的研究人员称，他们开发了一种名为Bulk RNA Barcoding and sequencing(BRB-seq)的新方法，其价格比传统商业便宜25倍RNA测序技术。

据报道RNA测序技术发展得更快更便宜

科学家指出，BRB-seq具有许多优点，可快速保留链特异性。因此，BRB-seq提供了一种低成本的方法，用于在数百个RNA样本上进行转录组学，这可以在一次运行中增加生物学重复的数量(因此实验准确性)，Deplancke解释说，他的团队的工作(“BRB-” seq：通过大量RNA条形码和测序实现的超可负担的高通量转录组学“在Genome Biology中出现。

在性能方面，科学家发现BRB-seq可以在相同的测序深度检测到与商业技术相同数量的基因，即使使用低质量的RNA样本，该技术也能产生可靠的数据。此外，根据Deplancke的说法，它产生的全基因组转录组学数据的成本与使用RT-qPCR分析四种基因的成本相当，RT-qPCR目前是一种标准的低通量方法，用于测量基因表达。

在测试中，BRB-seq可以生成每天最多192个样品的即用型基因组文库，只需要两个小时的实际操作时间。该技术与用于预处理和分析测序数据的管道相结合，据报道允许在一天内获得结果。

“自发布以来，已有数十家实验室和公司与我们联系，帮助他们实施BRB-seq方法，”Deplancke说。“由于BRB-seq的低成本，这些研究人员意识到他们现在可以用相同的预算分析更多的样品，从而大大增加了他们实验的范围和可重复性。因此，我们预计BRB-seq或类似方法将在任何分子生物学实验室中成为标准，并取代RT-qPCR作为第一个基因表达谱分析选项。

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