科普围产期和扩张型心肌病及II期和III期结肠癌
围产期心肌病与特发性扩张型心肌病具有某些临床特征,这种疾病是由40多个基因(包括编码肌节蛋白滴定蛋白的TTN)突变引起的。
方法
在172例围产期心肌病妇女中,我们对43个基因进行了测序,这些基因的变异与扩张型心肌病有关。我们比较了这些女性中不同变异类型(废话,移码和剪接)的患病率与扩张型心肌病患者和人群控制人群中此类变异的患病率。
结果
我们在围产期心肌病妇女中的八个基因中鉴定出26个不同的罕见截短变体。截短变异的患病率(172个中的26个[15%])显着高于参考人群60,706人(4.7%,P = 1.3×10 -7),但与散瞳患者的相似心肌病(332名患者中的55名[17%],P = 0.81)。在10%的患者和1.4%的参考人群中,三分之二的已确定的截短变异体存在于TTN中(P = 2.7×10 -10);几乎所有TTN变体都位于titin A波段。TTN中的七个先前曾报道特发性扩张型心肌病患者存在截短变体。在临床上特征明确的83名围产期心肌病女性队列中,TTN截短变体的存在与1年随访时的射血分数降低显着相关(P = 0.005)。
结论
在围产期心肌病的大量女性中,截短变异体的分布与特发性扩张型心肌病患者的分布明显相似。TTN截短变体是每种疾病中最普遍的遗传易感性。
高危II期结肠癌的识别是选择术后需要辅助治疗的患者的关键。源自干细胞和祖细胞的基于微阵列的多基因表达签名具有广阔的前景,但在临床实践中很难使用。
方法
我们使用一种新的生物信息学方法来搜索整个基因表达阵列中结肠上皮分化的生物标记,然后根据临床级诊断分析的可用性对候选基因进行排名。通过亚组分析,包括独立或回顾性研究II期或III期结肠癌患者的研究,测试了候选候选基因与无病生存期和辅助化疗获益的关系。
结果
转录因子CDX2在我们的筛选测试中排名第一。2115个肿瘤样品中有87个(4.1%)缺乏CDX2表达。在发现数据集,其中包括466例患者,5年无病生存率为32例患者(6.9%)与间下CDX2阴性结肠癌比434(93.1%)中以CDX2-阳性结肠癌(疾病复发风险比,3.44; 95%置信区间[CI],1.60至7.38; P = 0.002)。在包括314名患者的验证数据集中,CDX2蛋白阴性结肠癌的38名患者(12.1%)的5年无病生存率低于CDX2蛋白阴性结肠癌的276名(87.9%)结肠癌阳性(风险比为2.42; 95%CI为1.36至4.29; P = 0.003)。在这两个组中,这些发现均与患者的年龄,性别以及肿瘤的分期和等级无关。在患者的II期癌症,5年无病生存率差异有显著无论是在发现数据集(49中15例患者%CDX2阴性肿瘤与191名之间的患者87%CDX2阳性数据,P = 0.003)和验证数据集中(15例CDX2阴性肿瘤患者中51%,而106例CDX2阳性肿瘤患者中80%,P = 0.004)。在所有患者队列的汇总数据库中,接受辅助化疗的23例II期CDX2阴性肿瘤患者的5年无病生存率高于未接受辅助化疗的25例
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