研究验证了卫生保健获得性感染的测试
转化基因组学研究所(TGen)的一项新研究详细介绍了一种低成本,快速且高度准确的筛查工具(称为KlebSeq)的设计和验证,该工具可用于潜在的致命性医疗保健性感染(HAIs),例如肺炎克雷伯菌。HAI每年会影响数十万患者,并增加相关医疗费用近100亿美元。
该发现将发表在10月的《临床微生物学杂志》上,其中详细介绍了KlebSeq测试在更早发现HAI时的工作原理,特别是Klebsiella,它具有多种菌株,例如ST258,对抗生素的治疗越来越耐药。
传统的分析方法要求在实验室环境中培养活的培养物,这会增加测试时间并增加成本,而传统的分析方法则与之不同,KlebSeq采用一种称为扩增子测序的技术,该技术可识别克雷伯菌的存在并对其特征进行分层,例如菌株类型以及是否分离它可能是抗生素耐药的。
TGen病原基因组学部的博士后研究员Jolene Bowers博士说:“ KlebSeq能够从许多不同类型的样本样品中准确,一致地鉴定和鉴定克雷伯菌,包括血液,尿液,鼻拭子和呼吸液。 TGen North,是该论文的第一作者。
2015年,鲍尔斯与美国疾病控制与预防中心合作领导了一项在PLOS ONE上发表的研究,该研究记录了ST258在全球的迅速普及。
根据美国疾病预防控制中心(CDC)的数据,每年约有200万美国人感染对至少一种抗生素具有抗药性的细菌感染,每年死于这种感染的人数为23,000,几乎是死于艾滋病的人数的两倍。
鲍尔斯说:“改进的检测技术在快速检测HAIs和更快速地鉴定出耐药菌感染方面具有巨大潜力,例如肺炎克雷伯菌,已成为紧急的公共卫生危机。” “ KlebSeq是基于基因组的分析工具的强大典范,可以更快,更准确,更低成本地提供结果。”
根据TGen North项目和运营总监David Engelthaler博士以及该研究的作者之一所说,耐多药肺炎克雷伯菌菌株的传播迅速且没有初始症状,从而导致医疗体系和疾病暴发。经常未被发现的社区。
Engelthaler博士说:“在医疗保健患者中,尤其是那些具有多重耐药菌株的肺炎克雷伯氏菌的早期检测,对于控制感染至关重要。” Engelthaler博士说。“也许最令人担忧的是,Kleb就像是关键抗性基因的穿梭者,经常将它们传播给其他HAI物种。对我们而言,检测细菌和这些关键基因非常重要。”
KlebSeq可用于例行筛查和监视,使医护人员能够通过迅速识别出感染前有感染迹象的传播来做出更明智的患者决定,并遏制暴发情况。对每位患者的感染类型进行分类将有助于机构决定何时以及采用哪种干预程序。
研究结果表明,KlebSeq对高危患者特别有用,这些患者包括重症监护病房,专门从事骨髓移植或长期免疫抑制的患者,长期护理机构以及从流行地区返回的旅行者。
TGen North主任,该研究的资深作者Paul Keim博士说:“ KlebSeq的敏感性优于基于文化的方法。”
Keim博士说:“ KlebSeq是朝着全面,可访问的工具进行所有病原体鉴定和表征迈出的重要一步,” Keim博士同时还是北亚利桑那大学微生物学研究中心的Cowden捐赠主席,NAU微生物遗传学和生物医学研究中心主任。基因组学(MGGen)。
结果还表明,可以轻松修改KlebSeq以检测其他医疗保健获得的传染原,并鉴定具有抗药性的传染原。通过能够同时筛查数百个患者样本,每位患者花费数十美元,它也可以用于爆发检测,传播映射和追踪感染源。
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