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新技术在没有显微镜的情况下映射细胞中的RNA

一种新开发的称为DNA显微镜的方法可以准确地确定细胞内mRNA分子的位置,并生成转录本的可视图谱 - 所有这些都不需要实际使用显微镜。

新技术在没有显微镜的情况下映射细胞中的RNA

该技术于今天(6月20日)发表于Cell,其工作原理是首先将细胞培养物中选定的RNA转化为cDNA,然后用独特的核苷酸标记每个分子。然后这些标记物自身扩增,当它们扩展到与另一个cDNA标记物接触时,连接本身就会得到一个独特的核苷酸标签。任何两个cDNA越接近,它们产生的连接标签就越多。

正如科学所描述的那样,“为了统计标签,研究人员研磨细胞并分析它们所含的DNA。然后计算机算法可以推断出DNA分子的原始位置以产生图像。“

“我第一次看到DNA显微镜图像,它让我感到震惊,”共同作者,Broad Institute的计算和系统生物学家Aviv Regev告诉纽约时报。

研究人员将他们的计算机生成的图像与相同细胞的真实显微镜图像进行了比较,发现尽管DNA显微镜检查并不清晰,但所选mRNA的位置都是准确绘制的。“显微镜检查的关键弱点仍然是空间的解决,”当RNA分子相距很远时,可能会扭曲地图,Regev和她的同事在他们的研究中写道,“并且需要进一步的工作来消除这个障碍在分子密度存在差距的情况下,生产高质量的高质量样品重建。“

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