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兰花Apostasia shenzhenica的基因组测序

2019-05-28 08:46:19 • 来源：

一个大型国际研究团队对兰花Apostasia shenzhenica的基因组进行了测序。在他们发表在Nature杂志上的论文中，该团队描述了他们使用的方法以及他们在此过程中学到的知识。

兰花Apostasia shenzhenica的基因组测序

正如研究人员指出的那样，兰花在当今世界普遍存在是轻描淡写的，它们目前约占所有开花植物物种的10%，并且除了地球上最极端的栖息地外，它们已经被殖民化了。由于其强大的迁移和变化能力以适应各种条件，它多年来引起了科学家的兴趣。在这项新的努力中，研究人员将他们的工作重点放在了中国东南部发现的一种兰花Apostasia shenzhenica上。它主要是绿色，有黄色的花朵。了解花的基因组构成揭示了它进化的方式，以适应新的条件。

研究人员报告称，他们使用10x基因组学支架进行短读和长读测序，以开发植物的基因组序列。他们还报告说，他们使用他们的工作结果将植物与其他兰花进行比较，以分离出与使用转录组数据不同的部分相同的部分。

研究小组发现，A。shenzhenica提供了强有力的证据证明它包含在兰花科中 - 大部分基因组是其他兰花类型的虚拟拷贝。他们还怀疑，它发现数百万年前它与其他兰花分离 - 接近兰花最初存在的时间点。他们还发现兰花经历了一个主要的灭绝期，之后植物分化并随后演变成五个亚科。他们认为，正是在这个时期，着名的“嘴唇”等特征得以发展。

研究小组的研究结果表明，该植物是进一步研究的良好候选者，因为它可能提供进化线索，例如导致兰花有花粉症(花粉质量)的因子和比其他植物更轻的种子。它也可能解释另一个众所周知的特性 - 使用其他植物获得支持的能力。

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