葫芦基因组提供了关于进化历史瓜类植物关系的见解

来自博伊斯汤普森研究所(BTI)，美国农业部(USDA)的研究人员以及中国和法国的合作者已经为葫芦(Lagenaria siceraria)和最重建的基因组产生了第一个高质量的基因组序列。最近的葫芦科祖先。

根据协议(58-0210-3-012)，美国国际开发署作为未来饲料计划的一部分并在美国农业部国家粮食和农业特殊作物研究倡议组织的资助下(2015-51181)支持该研究。 -24285)。

葫芦也被称为葫芦，因其在食品，医药和新奇产品(如乐器，器具，容器和装饰品)中的众多实用和文化意义的用途而受到重视。作为其他葫芦科作物的砧木，葫芦也可作为基因组研究兴趣的目标。

尽管如此，还没有高质量的葫芦基因组序列，现代葫芦科植物的大部分进化历史及其遗传关系仍然很大程度上未知。

在他们的发现中，研究人员将测序的葫芦基因组与其他葫芦科植物的基因组进行了比较，使它们能够重建葫芦科的古老基因组历史。

“利用这个基因组和葫芦科物种的其他可用基因组，包括西瓜，甜瓜，黄瓜和南瓜，我们重建了葫芦科最新共同祖先的基因组，它提供了对葫芦科基因组进化的古历史的见解，”张军飞说。，BTI副教授。

高质量的葫芦基因组序列还提供了葫芦和其他葫芦科植物之间遗传关系的全面收集，可用于加速葫芦质量的改善和对疾病和寒冷等压力因素的耐受性。

“这项研究将使研究人员能够发现新的基因，并开发出可用于培育更高水果品质和更多抗病葫芦品种的新分子标记，”费说。

研究人员能够通过定位与一种特别具有破坏性的疾病相关的基因来展示基因组序列的实用性：木瓜环斑病毒(PRSV)。

美国农业部农业研究局(USDA-ARS)的研究植物病理学家Kai-Shu Ling说：“高质量的瓶子基因组帮助绘制了一种赋予PRSV抗性的基因座，PRSV是世界范围内感染木瓜和葫芦的最具破坏性的病毒之一。” 。

“基因组序列无疑将有助于在葫芦中发现其他抗病基因和许多其他有益的特性，”Ling说。

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