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儿童哮喘与成人哮喘相关的基因几乎是基因的3倍

研究人员报告说,一项全基因组关联研究(GWAS)证明,儿童期哮喘发病率与成人哮喘相关的基因数量几乎是其三倍。与成人哮喘相关的基因是与儿童期哮喘相关的基因的一部分,几乎所有对成人哮喘的影响都小于儿童期哮喘。

儿童哮喘与成人哮喘相关的基因几乎是基因的3倍

该团队的工作(“儿童期发病和成人哮喘的共同和不同的遗传风险因素:全基因组和转录组研究”)出现在柳叶刀呼吸医学中。

“我们使用来自英国生物银行的数据对哮喘患者进行了全基因组和转录组研究,其中包括患有儿童期哮喘的成人(12岁前发病),成人哮喘患者(26岁以内)和65岁的人,以及没有哮喘的成年人(对照组;年龄超过38岁)。我们对儿童哮喘和成人哮喘的全基因组关联研究(GWAS)进行了比较,共同对照组和所有哮喘患者的哮喘发病年龄,全基因组显着性阈值p <5×10-8。富集研究确定了GWAS基因座中基因表达最高的组织,PrediXcan(一种基于转录组的基因检测)用于鉴定候选风险基因。

“在来自英国生物银行的376,358名英国白人中,我们包括了37,846名医生诊断为哮喘的自我报告:9,433名患有儿童期哮喘的成年人;21,564名患有成人哮喘的成年人;另有6,849名年轻成年哮喘患者,发病年龄在12至25岁之间。对于第一次和第二次GWAS分析,使用318,237例38岁以上没有哮喘的个体作为对照。我们检测到61个独立的哮喘位点:23个是儿童期发病特异性,一个是成人发病特异性,37个是共有的。19个基因座与哮喘发病年龄相关。最显着的哮喘相关位点为17q12(优势比1·406,95%CI 1·365-1·448; p = 1·45×10-111)在儿童期发病的GWAS中。儿童期发病特异性基因座的基因在皮肤,血液和小肠中表达最高;成年发病特异性基因座的基因在肺,血液,小肠和脾中表达最高。PrediXcan在61个GWAS基因座中的22个中鉴定出113个独特的候选基因。基于单核苷酸多态性的遗传力估计值比儿童哮喘(0·327)大三倍于成人发病(0·098)。儿童期疾病的发病与具有相对大的效应大小的其他基因相关,在FLG基因座处观察到的最大比值比为1q21.3(1·970,95%CI 1·823-2·129)。

“成人哮喘的遗传风险因素主要是儿童期哮喘的遗传风险的一个子集,但总体上影响较小,表明非遗传风险因素在成人哮喘中的作用更大。结合基因表达和组织富集模式,我们认为儿童疾病的确立更多是由失调的过敏和上皮屏障功能基因驱动的,而成人哮喘的原因更多是以肺为中心和环境决定,但有免疫力促进儿童和成人疾病进展的相关机制。“

该研究的共同作者,芝加哥大学人类遗传学系教授兼主席Carole Ober博士及其合作者Hae Kyung Im博士,助理教授,“这是迄今为止最大的与哮喘相关的GWAS”。医学系。“我们发现参与成人哮喘的基因主要是与儿童哮喘有关的基因的一个子集。然而,在晚年,相同的基因往往具有较小的影响。“

作者补充说,“童年特异性和共有位点与年轻时哮喘的发展有关,这些等位基因在儿童期发病时与成人发病的哮喘相比都有较大的影响。”

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