使用CRISPR-Cas9筛选优先考虑癌症治疗靶标
功能基因组学方法可以克服限制 - 例如缺乏对强健靶标的鉴定和较差的临床疗效 - 这阻碍了癌症药物的开发。在这里,我们在来自30种癌症类型的324种人类癌细胞系中进行基因组规模的CRISPR-Cas9筛选,并开发了数据驱动的框架,以优先考虑癌症治疗的候选者。
我们将细胞适应性效应与基因组生物标记物和用于药物开发的目标易处理性相结合,以系统地优先定义组织和基因型中的新靶标。我们验证了我们最有希望的依赖性之一,Werner综合征ATP依赖性解旋酶,作为多种癌症类型肿瘤的合成致死靶标,具有微卫星不稳定性。
我们的分析提供了癌症依赖的资源,制定一个框架,优先考虑癌症药物目标,并提出具体的新目标。本研究中描述的原则可以为药物开发的初始阶段提供信息,为新的,多样化和更有效的癌症药物目标组合做出贡献。
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