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具有序列切割偏好的Dicer样酶

研究人员不断发现小RNA的新功能。例如,它们可以用作抵御病毒或自我复制基因组入侵者的防御机制。这些微小的RNA通常是通过所谓的Dicer蛋白裂解长前体而产生的。令他们惊讶的是,伯尔尼大学的研究人员发现,一些Dicers获得了一种独特且尚未知的特征,使他们能够以非常特殊的方式切割RNA前体,从而使小RNA更有效地发挥作用。

具有序列切割偏好的Dicer样酶

在人类细胞和社会中:一切都与信息有关。读取基因,产生信息分子(称为信使RNA或短mRNA),并根据说明书合成蛋白质。这些信使物质还有很多,蜂窝设备是一个巨大的信息中心,是一个精心管理的业务。并且好像所有这些信息交换都不够复杂:在过去几年中,与RNA相关的研究已经发现越来越多的证据表明监管也在更高层次上运作。信息管理本身是高度动态的 - 信息物质被阻止,它们被改变,有时甚至被切碎。

明智地选择削减

特别是在真核生物中,信息碎片称为小RNA(sRNA)的分子在发育,基因表达和基因组稳定性中具有关键作用。它们由一系列不同的蛋白质产生。其中一种最着名的叫做Dicer,用长链双链RNA模板切割它们。到目前为止,当涉及到拆除RNA时,Dicer被认为是一个伐木工人 - 只是将其劈成大小相等的短片段,不特别注意片段的形式和内容。这些蛋白质从未被证明具有序列切割偏好,但最近由Mariusz Nowacki领导的伯尔尼大学细胞生物学研究所的研究小组发现了具有真正令人惊讶品质的Dicer样酶。蛋白质工程。

该研究小组是NCCR“RNA和疾病”的一部分,研究小组发现,在使用小RNA来指导消除入侵转座DNA元件的微生物草履虫中,一些类似Dicer的蛋白质正在切割RNA更多尽职尽责。正如Cell,Cristina Hoehener,Iris Hug和Mariusz Nowacki所述,他们的Dicer样酶具有严格的大小和明显的序列偏好。这些偏好导致sRNA的产生与其靶DNA元件的末端精确匹配,这导致研究人员提出这些新表征的酶及其裂解产物的尚未知的生物学作用。

小RNA修复DNA

他们认为这些类似Dicer的蛋白质通过在其末端精确积累来促进消除不需要的DNA元素。然后这些累积触发从遗传物质中消除DNA的“突出”部分。转座子是基因组的外来部分,渗透到DNA中,具有从DNA的一部分跳到另一部分的能力。这使它们特别危险,因为它们可以触发各种不需要的遗传效应。因此,有机体完全有理由快速有效地摆脱这些DNA片段。

研究人员特别感兴趣的是这些Dicer酶的精确度。与仅在识别非常特异性序列时切割的限制性酶相比,草履虫Dicer蛋白质在某种程度上起作用 - Nowacki将其称为“放松的偏好”。研究人员认为,过于严格的偏好在这里是不合适的:为了使DNA修复有效,重要的是许多sRNA片段可以在正确的片段组装。如果Dicer过于挑剔,它将无法为所有危险的外来DNA产生合适的片段。“模糊不一定是坏事,”Nowacki说。

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