将HIV-1包膜糖蛋白结构与smFRET观察到的病毒状态联系起来
的HIV-1包膜糖蛋白(Env的)三聚体介导细胞进入和构象上是动态1,2,3,4,5,6,7,8。通过单分子荧光共振能量转移(smFRET)成像显示,在完整病毒粒子的表面上,成熟的融合前Env从预先触发的构象(状态1)转变为默认的中间构象(状态2)到构象在其被结合到三个CD4受体分子(状态3)8,9,10。
目前尚不清楚这些状态如何与已知结构相关。先前已经通过产生可溶的和蛋白水解切割的gp140 Env三聚体来实现HIV-1 Env三聚体的结构表征的突破,所述三聚体通过二硫键稳定,残基559处的异亮氨酸至脯氨酸取代和残基664处的截短。
(SOSIP.664三聚体)5,11,12,13,14,15,16,17,18。用抗体PGT15119复合的HIV-1JR-FL株的C末端截短的Env进行了冷冻电子显微镜研究。。这两种方法都揭示了Env的类似结构。虽然这些结构被认为代表HIV-1 Env的预触发状态1,但这种假设从未直接测试过。
在这里,我们使用smFRET来比较用于结构研究的Env三聚体与完整病毒上的天然Env的构象状态。我们发现现存的高分辨率结构所基于的构建体主要占据代表状态2和3的下游构象。因此,已经通过smFRET鉴定的病毒Env的预触发状态-1构象的结构是优先被许多广泛中和的抗体稳定 - 因此对免疫原的设计感兴趣 - 仍然未知。
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