Illumina Lundbeck基金会地球遗传学中心研究微生物在神经精神疾病中的作用
Illumina和哥本哈根大学的Lundbeck基金会地球遗传学中心今天表示,他们将合作探索选择性精神和神经疾病的进化史与传染性病原体之间的关系。
该合作的价值未公开,旨在为精神和神经疾病的治疗方法的发展提供新方法。Illumina和该中心表示,他们计划将这些方法建立在他们收集的洞察力基础上,因为他们研究微生物在神经精神疾病(如阿尔茨海默病和精神分裂症)的发病机制中的作用。
合作伙伴补充说,他们的目标是了解更多关于人类神经精神疾病发展的特殊因素的医学和生物学理解。了解这些因素有望帮助研究团队更好地了解疾病变异的演变及其与人类基因组和病原体压力的相互作用。
为此,哥本哈根大学Lundbeck基金会教授Eske Willerslev,DSc及其同事计划通过对成千上万古欧亚人类遗骸进行完整的DNA绘图,建立有史以来最大的古代人类和病原体基因组参考区之一。 。
Illumina和该中心表示,数据将来自骨骼和牙齿,最古老的遗骸可以追溯到10000年前。
Willerslev是一位进化遗传学家,他早年的成年生活就像一个皮毛捕手一样,发现了西伯利亚东北部偏远的原始状态。他的探险活动将他带到了北极的海岸线上,这些海岸线上布满了哺乳动物的遗骸,就像贝壳在海边拍打着一样。探索荒野是一个儿时的梦想,他说,并补充说:“但我现在可以看到,那时候,不只是冒险,我试图了解环境。”
在与Illumina的合作中,Willerslev将领导一个国际化,多学科的科学家团队,计划专注于创建两个独特的基因组数据子集 - 一个由5,000个古老的人类基因组组成的小组,以及一个由古老的病原体DNA组成的小组。与人类疾病有关。两个小组都将公开发布。
在过去的一万年中,人类经历了我们物种历史上一些最大的生活方式变化,“Willerslev,也是剑桥大学菲利普亲王教授和Wellcome Trust Sanger Institute的研究员,在声明中说。“随着我们从狩猎采集者发展成为农民,我们的饮食发生了变化,我们的定居模式发生了变化,并且由于生活条件的改变,我们所暴露的病原微生物的感染压力发生了变化。
了解疾病的演变
“我们也知道慢性病毒,细菌和真菌感染可能是神经精神疾病的致病因素,因此有充分的理由相信这一时期的DNA分析将显示出显着的趋势,使我们能够公开创造新的可用的参考集,以加强科学和医疗社区对疾病演变的理解,“Willerslev补充说。
Willerslev和他的团队将使用Illumina的NovaSeq™6000测序系统,并利用Illumina的S4流通池每两天测序多达200亿个古老的DNA片段。
NovaSeq是Illumina目前的顶级音序器,自推出以来的两年内,2018年的收入达到10亿美元,使Illumina成为任何产品的最快收入增长点。NovaSeqs对超过600,000个全基因组进行了测序,其中约30%的NovaSeq客户是Illumina的新用户或从台式测序仪转换而来,约有25%是HiSeq客户,首席执行官Francis deSouza在1月份的摩根大通第37届医疗保健会议上表示。
“虽然我们在几年前构思这个项目来探索遗传疾病的进化起源,但在Illumina的NovaSeq系统上市之前根本无法实现,”Willerslev说。“我们很高兴Lundbeck基金会有先见之明,看到我们项目的重要性,Illumina的技术将使研究成为可能。”
Lundbeck基金会脑,疾病和进化地球遗传学中心专门研究人类,病原体和环境DNA的古老DNA研究。该中心探索人类迁徙,疾病演变,适应生活方式变化和语言发展。该中心表示,其目标是通过了解疾病病因和尊重我们的多样性来增加我们对人类意义的相互欣赏以及减少痛苦。
该中心成立于2009年,是丹麦国家研究基金会的卓越中心,并通过伦德贝克基金会,嘉士伯基金会,诺和诺德基金会和威康信托基金的资助继续开展工作。
“这将是非常有价值的,如果回到1万年后,我们可以获得有关何时以及在何种环境条件下,脑部疾病可能被引入人类DNA的新信息,”高级副总裁兼总经理Paula Dowdy补充道。适用于Illumina的欧洲,中东和非洲。“通过为受精神健康问题影响的人提供宝贵的见解,该项目有可能影响遗传学和精准医学的未来产品开发。”
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