RNA seqFISH +在组织中的转录组规模超分辨成像
成像在高精度原位转录已经在单细胞生物学的一个重大挑战,这是特别地通过光学分辨率的极限而在单个细胞中的转录物的密度受阻1,2,3,4,5。
在这里,我们展示了顺序荧光原位杂交(seqFISH +)的演变。我们显示seqFISH +可以使用标准共聚焦显微镜在单个细胞中对10,000个基因的mRNA进行成像 - 具有高精度和亚衍射极限分辨率 - 在小鼠脑的皮层,脑室下区和嗅球中。
seqFISH +的转录组水平分析允许无偏识别细胞类别及其在组织中的空间组织。此外,seqFISH +揭示细胞和邻近细胞的配体 - 受体对中的亚细胞mRNA定位模式。该技术展示了生成空间细胞地图集和对原位生物过程进行发现驱动研究的能力。
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