乳腺癌复发的动态显示晚期复发的ER阳性基因组亚组
由于缺乏具有长期详细随访数据的分子特征性患者队列,因此人们对乳腺癌致死系统性传播的发生率和途径知之甚少。长期随访是为那些与雌激素受体(ER)阳性乳腺癌,可以初步诊断后复发长达二十年特别重要1,2,3,4,5,6。因此,必须确定谁做晚期复发的高危患者7,8,9。
在这里,我们提出了一个统计框架,模拟不同的疾病阶段(局部复发,远处复发,乳腺癌相关死亡和其他原因死亡)和乳腺癌死亡率的竞争风险,同时产生个体复发风险预测。我们将此模型应用于3,240名患有乳腺癌的患者,其中包括1,980名可获得分子数据的患者,并描绘了不同类别分子信息(即免疫组化亚型;基于基因表达模式10的 PAM50亚型)的复发的时空模式,11 ;和综合或IntClust亚型,其是基于基因组拷贝数变化和基因表达模式12,13)。
我们确定了四种晚期复发的整合亚型,包括约四分之一(26%)的肿瘤,这些肿瘤既有ER阳性,也有人表皮生长因子受体2阴性,每种都有特征性的肿瘤驱动改变,基因组拷贝数和高风险复发(平均47-62%),确诊后20年。我们还定义了三阴性乳腺癌的亚组,其中癌症在五年后很少复发,并且是一个单独的亚组,其中患者仍然处于危险之中。整合亚型的使用改善了对临床协变量(结节状态,肿瘤大小,肿瘤分级和免疫组织化学亚型)可能的晚期远程复发的预测。这些研究结果突出了改善患者分层和生物标志物驱动的临床试验的机会。
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